TAGC - Technologies Avancées pour le Génome et la Clinique

Dernière mise à jour : juin-juillet 2009

Inserm U928 - TAGC

Parc Scientifique et Technologique

de Luminy - Case 906
13009 Marseille
Tél : 04 91 82 87 02

Fax : 04 91 82 87 01

http://tagc.univ-mrs.fr

Année de création (sur Luminy) : 2002
Effectif : 48
Directeur : Dr. Catherine Nguyen

Thématiques/missions :

Analyse intégrative des réseaux de régulation transcriptionnelle impliqués dans les pathologies et les réactions immunitaires

Les travaux du TAGC s'inscrivent dans le domaine de recherche en biologie désigné par le terme "biologie systémique". En combinant les données produites à la paillasse dans notre laboratoire à celles trouvées dans la littérature et les bases de données, nous développons des méthodes expérimentales et théoriques pour décrypter les mécanismes moléculaires à la base de l'activation et de la différenciation cellulaire des lymphocytes T en réponse à divers signaux. Nous utilisons les mêmes approches au laboratoire et en collaboration dans le but d'élucider la nature des dé-régulations à l'origine de pathologies humaines telles que les cancers (cancer du sein, gliome, hémopathies malignes), le sepsis sévère et le paludisme.

Notre approche combine :

- l'analyse transcriptionnelle de tissus ou cellules provenant de patients ou de modèles murins par puces à ADN ; 

- l'analyse de la régulation transcriptionnelle par des approches phylogénomiques, fonctionnelles et protéomiques combinées à des études de modifications post-traductionnelles ;

- l'analyse et la modélisation des modules de régulation sous-jacents à l'aide d'outils bioinformatiques et mathématiques (statistiques, modélisation dynamique, etc.).

L'ensemble de ces travaux stimule le développement d'outils diagnostics et pronostics, ainsi que de nouvelles stratégies thérapeutiques innovatrices pour remédier aux défauts de régulation de la réponse immunitaire à l'origine de maladies auto-immunes et de cancers, du rejet de greffe ou de stratégies d'échappement développées par les agents pathogènes infectieux.

Notre activité s'organise à travers les thèmes suivants :

01 - Analyse transcriptionnelle du développement thymique (Catherine Nguyen)
02 - Analyse intégrative de réseaux de régulation transcriptionnelle impliqués dans le cancer, l'activation et la différenciation lymphocytaire (Jean Imbert, Denis Puthier, Régis Costello)
03 - Factorologie de la régulation de l'expression génique (Brigitte Kahn-Perlès)
04 - Le sepsis sévère (Catherine Nguyen)
05 - Génomique de la résistance de l'hôte au paludisme (Pascal Rihet)
06 - Modélisation et analyse bioinformatiques des réseaux de régulation et d'interactions fonctionnelles (Denis Thieffry, Christine Brun, Carl Hermann)
07 - Plate-forme Transcriptome et Séquençage à haut débit IBiSA Hotel Express (Béatrice Loriod, Catherine Nguyen, Jean Imbert)